Mme Pascale BAUDA
Professeur
Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux
UMR 7360 CNRS - Université de Lorraine

Campus Bridoux, Bât. IBISE, 8 rue du Général Delestraint
57070 METZ, FRANCE

Tel :       +33(0)3 72 74 89 75
Fax :     +33(0)3 72 74 89 74
e-mail : pascale.bauda(@)univ-lorraine.fr
Responsabilités administratives
Directrice adjointe du LIEC jusqu'au 1 janvier 2018
Membre du CS de l'Université de Lorraine jusqu'en mars 2017
Membre du conseil de l'UFR SciFA
Direction adjointe de l'OHM Pays de Bitche
Responsable de 3 Unités d'Enseignement
 
Thématiques de recherche
Impact des  métaux / métalloïdes, sur la diversité et le fonctionnement des communautés microbiennes, métabolismes microbiens des métaux et métalloïdes, impact environnemental de ces métabolismes. Impact des nanoparticules sur les microorganismes. Impact des contaminations d'origine militaires.
 
Projets en cours
Evaluation de l' impact des nanoparticules sur les réseaux  trophiques microbiens aquatiques (thèse de Anne Vicente co-dirigée avec Christophe Pagnout
Projet labex R21 : mobilité et transfert de l'antimoine en lien avec l'activité minière
ImpactE (porteur de projet avec Fabien Thomas): programme de transfert et d'Innovation du LIEC
Projet OHM Impact des contaminations/activités militaires sur la qualité des eaux et sédiments, interactions avec les microorganismes (collaboration avec Jessy Jaunat (Laboratoire GEGENAT).
Projet NEEDS avec l'IRSN sur l'impact du potentiel redox sur les métabolismes microbiens de l'Uranium
 
Enseignements / Encadrements
Écologie microbienne, génétique bactérienne, microbiologie, biotechnologies, ressources microbiennes, bioremédiation des sols, optimisation du traitement des eaux,  risques sanitaires.
 
Domaines de compétences
Microbiologie, génétique bactérienne, biologie moléculaire, écologie microbienne.
 
Cursus / Carrière / Distinctions
Maître de conférences,  en Biologie Cellulaire et Microbiologie, à luniversité de Metz, de Septembre 1989 à Septembre 1998.  Obtention de lHDR en 1991. A la suite du départ de Jean-Claude Block en 1991, jai assuré  le pilotage de léquipe de microbiologie du centre des Sciences de lEnvironnement luniversité de Metz composée dune technicienne et de DEA, doctorants (3 en direction et 1 en co-direction), jai implanté dans cette équipe les principaux outils de biologie moléculaire qui nexistaient pas dans le laboratoire, et jai développé des thèmes de recherche décologie microbienne moléculaire centrés sur leffets des métaux sur des souches modèles puis sur les biofilms (formation, dynamique,transferts de gènes, activité). Sur le plan pédagogique, sur la même période, jai été responsable dune filière de licence et maîtrise interdisciplinaire en chimie, biologie, biochimie, pour laquelle jétais aussi responsable des stages en entreprises. Durant cette période 4 thèses ont été soutenues sous ma direction. Deux de ces doctorants ont une carrière de chercheur (Pierre Genevaux, recruté au CNRS, Anne Marie Simao à lUniversité de Sherbrooke) les 2 autres sont dans le secteur privé.J'ai été titulaire d'une PEDR de 1996 à 1998.
Mes travaux de recherche ont été à cette époque financés sur des contrats avec des entreprises privées ou des associations financées par le secteur privé : Chimie Ecologie (financée par le secteur de la chimie), Lyonnaise des eaux-CIRSE. 

De Novembre 1998 à Juillet 2002, jai effectué une mobilité en tant que chercheur senior dans la compagnie PhageTech, Montréal, Canada. Il sagissait dune start-up de biotechnologie, issue de lUniversité McGill, dont la stratégie était exploitation de létude des génomes de bactériophages spécifiques de bactéries pathogènes (Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa) afin de mettre en évidence de nouvelles cibles sur lesquelles des molécules à activité antibiotique pourraient être criblées. Ces quatre années dans le secteur privé ont été très profitables sur les plans à la fois méthodologiques, scientifiques et organisationnels. Ils ont donné lieu à 3 publications et un brevet.
   
Depuis Septembre 2002, jai rejoins, en tant quenseignant chercheur, le laboratoire Ecotoxicité et Santé Environnementale (ESE). jai été nommée Professeur (CNU section 65) en Février 2005. Le laboratoire a été labellisé FRE CNRS puis UMR.  En plus de mes activités denseignement, je me suis investie dans la labellisation dun master représentant un flux de 150 étudiants répartis dans 7 spécialités. Puis dans le management de l'UMR LIEBE en tant que directeur adjoint, puis en assurant la direction de lUMR, et plus recemment dans la construction de l'UMR  LIEC dont je suis directrice adjointe. Depuis 2004, je me suis investie dans les missions dévaluation de la recherche au niveau national en étant que membre de 2 sections du comité national sur le mandat 2004-2008, et en assurant la présidence de la section 20 de 2008 à 2012. La réinsertion dans le monde universitaire depuis 2002, et la prise de responsabilités pédagogiques et dadministration de la recherche, ainsi que les évolutions thématiques de mon activité de recherche ont impacté mon activité de publication. Je suis titulaire dune PEDR/PES depuis 2007.
Depuis 2002,  4 thèses ont été soutenues, 3 thèses sont actuellement en cours. Mes travaux sont financés par des programmes nationaux ANR, CNRS et par le labex Ressources 21.

Résumé des activités de recherche :
1982-1987 : rôle des enveloppes bactériennes dans la résistance aux métaux, et de la spéciation des métaux dans la toxicité, développement de nouvelles mesures dactivités microbiennes appliquées aux communautés,
1987- 1990 : développement de biofilms bactériens  : détermination des constantes cinétiques
1989-1993 : transferts de genes horizontaux dans les biofilms et les boues activées
 1993-1998 : stratégies de bioaugmentation appliquées à la biodégradation des hydrocarbures par les biofilms et à la biodégradation de la matière organique dans un contexte de contamination mixte
1993-1998 : mécanismes dadhésion bactériennes sur des surfaces inertes
1998-2004 : génomique des bactériophages appliquée à la découverte de nouvelles stratégies antibiotiques (mobilité de 4 ans à Montréal, Qc, Canada, compagnie PhageTech Inc)
2004-present : métabolisme de l'arsenic par les communautés bactériennes
Depuis 2008 : écotoxicité des nanoparticules métalliques, mécanismes de toxicité sur les bactéries, impacts sur les communautés microbiennes : diversités et fonctions
Depuis 2008 : stratégies de remédiation des sols contaminés (contaminations multiples).
Depuis 2013 : biodisponibilité, métabolismes et transferts de l'antimoine
Depuis 2015: réduction microbienne de l'uranium
 
Publications
  • Publications internationales

LESCURE T., JOULIAN C., CHARLES C., SAANDA T.-B., CHARRON M., BREEZE D., BAUDA P., BATTAGLIA-BRUNET F., 2020. Simple or complex organic substrates inhibit arsenite oxidation and aioA gene expression in two beta-Proteobacteria strains. Research In Microbiology 171, 13-20     Réf. HAL: insu-02298717.  [doi]

PAGNOUT C., SOHM B., RAZAFITIANAMAHARAVO A., CAILLET C., OFFROY M., LEDUC M., GENDRE H., JOMINI S., BEAUSSART A., BAUDA P., DUVAL J.-F.-L., 2019. Pleiotropic effects of rfa-gene mutations on Escherichia coli envelope properties. Scientific Reports 9 (1)     Réf. HAL: hal-02185099.  [doi]

VICENTE A., SOHM B., FLAYAC J., ROUSSELLE P., BAUDA P., PAGNOUT C., 2019. Toxicity mechanisms of ZnO UV-filters used in sunscreens toward the model cyanobacteria Synechococcus elongatus PCC 7942. Environmental Science And Pollution Research     Réf. HAL: hal-02090651.

BOURCERET A., CÉBRON A., TISSERANT E., POUPIN P., BAUDA P., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2016. The Bacterial and Fungal Diversity of an Aged PAH- and Heavy Metal-Contaminated Soil is Affected by Plant Cover and Edaphic Parameters Microbial Ecology 71 (3), 711-724.  [doi]

LESCURE T., MOREAU J., CHARLES C., SAANDA T.-B., THOUIN H., PILLAS N., BAUDA P., LAMY I., BATTAGLIA-BRUNET F., 2016. Influence of organic matters on AsIII oxidation by the microflora of polluted soils Environmental Geochemistry And Health 38 (3), 911-925.  [doi]

BOURCERET A., CÉBRON A., TISSERANT E., POUPIN P., BAUDA P., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2015. The bacterial and fungal diversity of an aged PAH- and heavy metal-contaminated soil is affected by plant cover and edaphic parameters. Microbial Ecology 0.  [doi]

CORDI A., PAGNOUT C., DEVIN S., POIREL J., BILLARD P., DOLLARD M.-A., BAUDA P., 2015. Determination of physiological, taxonomic, and molecular characteristics of a cultivable arsenic-resistant bacterial community. Environmental Science And Pollution Research 22, 13753-13763.  [doi]

HUGUIER P., MANIER N., CHABOT L., BAUDA P., PANDARD P.,, 2015. Ecotoxicological assessment of organic wastes spread on land: Towards a proposal of a suitable test battery. Ecotoxicology And Environmental Safety 113, 103-111.  [doi]

HUGUIER P., MANIER N., OWOJORI O.-J., BAUDA P., PANDARD P., ROMBKE J., 2015. The use of soil mites in ecotoxicology: a review. Ecotoxicology 24, 1-18.  [doi]

JOMINI S., CLIVOT H., BAUDA P., PAGNOUT C., 2015. Impact of manufactured TiO2 nanoparticles on planktonic and sessile bacterial communities. Environmental Pollution 202, 196-204.  [doi]

LESCURE T., MOREAU J., CHARLES C., BEN ALI SAANDA T., THOUIN H., PILLAS N., BAUDA P., LAMY I., BATTAGLIA-BRUNET F., 2015. Influence of organic matters on AsIII oxidation by the microflora of polluted soils. Environmental Geochemistry And Health 15 pages.  [doi]

SOHM B., IMMEL F., BAUDA P., PAGNOUT C., 2015. Insight into the primary mode of action of TiO2 nanoparticles on Escherichia coli in the dark. Proteomics 15, 98-113.  [doi]

CÉBRON A., ARSÈNE-PLOETZE F., BAUDA P., BERTIN P.-N., BILLARD P., CARAPITO C., DEVIN S., GOULHEN-CHOLLET F., POIREL J., LEYVAL C , 2014. Rapid Impact of Phenanthrene and Arsenic on Bacterial Community Structure and Activities in Sand Batches. Microbial Ecology 67, 129-144..  [doi]

HUGUIER P., MANIER N., MELINE C., BAUDA P., PANDARD P. , 2013. Improvement of the Caenorhabditis elegans growth and reproduction test to assess the ecotoxicity of soils and complex matrices. Environmental Toxicology And Chemistry 32, 2100-2108..  [doi]

CLIVOT H., PAGNOUT C., ARAN D., DEVIN S., BAUDA P., POUPIN P., GUÉROLD F., 2012. Changes in soil bacterial communities following liming of acidified forests. Applied Soil Ecology, 59: 116-123.  [doi]

JOMINI S., LABILLE J., BAUDA P., PAGNOUT C., 2012. Modifications of the bacterial reverse mutation test reveals mutagenicity of TiO2 nanoparticles and byproducts from a sunscreen TiO2-based nanocomposite. Toxicology Letters, 215 (1): 54-61.  [doi]

PAGNOUT C., JOMINI S., DADHWAL M., CAILLET C., THOMAS F., BAUDA P., 2012. Role of electrostatic interactions in the toxicity of titanium dioxide nanoparticles toward Escherichia coli. Colloids and Surfaces B-Biointerfaces, 92: 315-321.  [doi]

HALTER D., CORDI A., GRIBALDO S., GALLIEN S., GOULHEN-CHOLLET F., HEINRICH-SALMERON A., CARAPITO C., PAGNOUT C., MONTAUT D., SEBY F., VAN DORSSELAER A., SCHAEFFER C., BERTIN P.N., BAUDA P., ARSÈNE-PLOETZE F., 2011. Taxonomic and functional prokaryote diversity in mildly arsenic-contaminated sediments. Research in Microbiology, 162 (9): 877-887.  [doi]

HEINRICH-SALMERON A., CORDI A., BROCHIER-ARMANET C., HALTER D., PAGNOUT C., ABBASZADEH-FARD E., MONTAUT D., SEBY F., BERTIN P.N., BAUDA P., ARSÈNE-PLOETZE F., 2011. Unsuspected diversity of arsenite-oxidizing bacteria as revealed by widespread distribution of the aoxB gene in Prokaryotes Applied and Environmental Microbiology, 77 (13): 4685-4692.  [doi]

MICHON C., PONS M.-N., BAUDA P., POIROT H., POTIER O., 2011. Arsenic mass balance in a paper mill and impact of the arsenic release from the WWTP effluent on the Moselle River. Water Science and Technology, 63 (7): 1349-1356.  [doi]

OUVRARD S., BARNIER C., BAUDA P., BÉGUIRISTAIN T., BIACHE C., BONNARD M., CAUPERT C., CÉBRON A., CORTET J., COTELLE S., DAZY M., FAURE P., MASFARAUD J.-F., NAHMANI J., PALAIS F., POUPIN P., RAOULT N., VASSEUR P., MOREL J.-L., LEYVAL C., 2011. In situ assessment of phytotechnologies for multicontaminated soil management. Int. J. Phytoremediation, 13, 245-263..  [doi]

ACHOUR-ROKBANI A., CORDI A., POUPIN P., BAUDA P., BILLARD P., 2010. Characterization of the ars Gene Cluster from the Extreme Arsenic-Resistant Strain Microbacterium sp. A33 Applied and Environmental Microbiology, 76 (3): 948-955.  [doi]

DEHBI M., MOECK G., ARHIN F.-F., BAUDA P., BERGERON D., KWAN T., LIU J., MCCARTY J., DUBOW M.-S., PELLETIER J., 2009. Inhibition of transcription in Staphylococcus aureus by a primary sigma factor-binding polypeptide from phage G1. Journal of Bacteriology, 191 (12): 3763-3771.  [doi]

ROKBANI-ACHOUR A., BAUDA P., BILLARD P., 2007. Diversity of arsenite transporter genes from arsenic-resistant soil bacteria. Research in Microbiology, 158 (2): 128-137.  [doi]

BELLEY A., CALLEJO M., ARHIN F., DEHBI M., FADHIL I., LIU J., MCKAY G., SRIKUMAR R., BAUDA P., BERGERON D., HA N., DUBOW M.S., GROS P., PELLETIER J., MOECK G., 2006. Competition of bacteriophage polypeptides with native replicase proteins for binding to the DNA sliding clamp reveals a novel mechanism for DNA replication arrest in Staphylococcus aureus. Molecular Microbiology, 62 (4): 1132-1143.  [doi]

LIU J., DEHBI M., MOECK G., ARHIN F., BAUDA P., BERGERON D., CALLEJO M., FERRETTI V., HA N., KWAN T., MCCARTY J., SRIKUMAR R., WILLIAMS D., WU J.J., GROS P., PELLETIER J., DUBOW M.S., 2004. Antimicrobial drug discovery through bacteriophage genomics. Nature Biotechnology, 22: 185-191.  [doi]

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GENEVAUX P., BAUDA P., DUBOW M.S., OUDEGA B., 1999. Identification of Tn10 insertions in the dsbA gene affecting Escherichia coli biofilm formation. FEMS Microbiology Letters, 173 (2): 403-409.  [doi]

THOUAND G., BAUDA P., OUDOT J., KIRSCH G., SUTTON C., VIDALI J.F., 1999. Laboratory evaluation of crude oil biodegradation with commercial or natural microbial inocula. Canadian Journal of Microbiology, 45 (2): 106-115.

LEBARON P., BAUDA P., LETT M.C., DUVALIFLAH Y., SIMONET P., JACQ E., FRANK N., ROUX B., BALEUX B., FAURIE G., HUBERT J.C., NORMAND P., PRIEUR D., SCHMITT S., BLOCK J.-C., 1997. Recombinant plasmid mobilization between E-coli strains in seven sterile microcosms. Canadian Journal of Microbiology, 43 (6): 534-540.

FRANK N., SIMAO-BEAUNOIR A.-M., DOLLARD M.-A., BAUDA P., 1996. Recombinant plasmid DNA mobilization by activated sludge strains grown in fixed-bed or sequenced-batch reactors. FEMS Microbiology Ecology, 21 (2): 139-148.  [doi]

GENEVAUX P., MULLER S., BAUDA P., 1996. A rapid screening procedure to identify mini-Tn10 insertion mutants of Escherichia coli K-12 with altered adhesion properties. FEMS Microbiology Letters, 142 (1): 27-30.  [doi]

BAUDA P., LALLEMENT C., MANEM J., 1995. Plasmid content evaluation of activated-sludge. Water Research, 29 (1): 371-374.  [doi]

OSSWALD P., COURTES R., BAUDA P., BLOCK J.-C., BRYERS J.D., SUNDE E., 1995. Xenobiotic biodegradation test using attached bacteria in synthetic seawater. Ecotoxicology and Environmental Safety, 31 (3): 211-217.  [doi]

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BAUDA P., BLOCK J.-C., 1990. Role of envelopes of gram-negative bacteria in cadmium binding and toxicity. Toxicity Assessment, 5 (1): 47-60.

BAUDA P., BOUZENDORFFER C., BLOCK J.-C., FAUP G., COLIN F., 1990. Characterization of bacterial biomass potential activity by proteolytic activity measurements. Environmental Technology, 11 (8): 785-792.

FALLA J., BAUDA P., BLOCK J.-C., 1988. Isolation of cell-envelope layers of Pseudomonas fluorescens. Journal of Microbiological Methods, 7 (6): 285-294.  [doi]

BAUDA P., BLOCK J.-C., 1985. Cadmium biosorption and toxicity to laboratory - grown bacteria. Environmental Technology Letters, 6 (10): 445-454.