Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP), composés majoritairement d'origine anthropique, ont été choisis comme modèles détude pour comprendre les mécanismes de biodégradation, par les microorganismes (bactéries et champignons), des polluants organiques « persistants » dans les sols. Dans les sols historiquement contaminés (friches industrielles), la biodégradation des HAP pourrait y être stimulée dans la rhizosphère de certaines plantes via l'action des exsudats racinaires. Les mécanismes impliqués méritent dêtre précisés, en prenant en compte la nature des exsudats racinaires, la disponibilité des HAP, et la diversité et l'activité des microorganismes. De plus, quel est le devenir des HAP dans les plante? Pour répondre à cette question je m'intéresse également au rôle des microorganismes endophytes (racinaires) sur la transformation et biodégradation des HAP, et sur le devenir des HAP dans la biomasse végétale.

Mes recherches visent à étudier le fonctionnement des sols historiquement contaminés et la dynamique des HAP dans les systèmes sol-plantes en me focalisant sur le fonctionnement spatio-temporel de la communauté microbienne fonctionnelle impliquée dans la biodégradation de ces polluants. Plus spécifiquement mes recherches ont pour objectifs de répondre aux questions suivantes : Quels sont les microorganismes présents et actifs dans les sols historiquement contaminés? Quels traits fonctionnels particuliers sont portés par ces communautés microbiennes? certaines fonctions essentielles y sont-elles absentes? Quel est le rôle des plantes, de la rhizosphère, des exsudats racinaires, et du compartiment endophytique sur la diversité et l'activité microbienne, notamment l'activité de biodégradation des HAP?

Par ailleurs, les environnements pollués sont encore trop peu étudiés du point de vu de la diversité microbienne qu'ils abritent. Une partie de mes recherches vise à identifier quels traits fonctionnels des microorganismes pourraient être de bons marqueurs de l'écotoxicité des polluants, et quels traits spécifiques sont sélectionnés dans les communautés microbiennes adaptés aux écosystèmes pollués.

• ANR EndOMiX, 2020-2024, « Role of plant-endophyte (bacteria and fungi) associations in polycyclic aromatic hydrocarbon biodegradation ».
  

• Projet HORIZON 2.6.6 - MIBIREM-Toolbox for Microbiome based Remediation, 2022-2027

• 2022. Directrice de Recherche, LIEC
  
• 2017. Habilitation à Diriger les Recherches (HDR), Université de Lorraine (Nancy), « Diversité taxonomique et fonctionnelle des communautés microbiennes de sols historiquement contaminés : impact des plantes et de la rhizosphère ».
• depuis 2013. Chargée de Recherche, CR1-CNRS (section 30), LIEC UMR 7360, CNRS-Université de Lorraine.

• 2012-2013. Chargée de Recherche, CR1-CNRS (section 20), LIMOS UMR 7137, CNRS-Nancy-Université.

• 2007-2012. Chargée de Recherche, CR2-CNRS (section 20), LIMOS UMR 7137, CNRS-Nancy-Université.

• 2005-2007. Post-Doctorat, LIMOS UMR 7137, CNRS-Nancy-Université.

• 2005. Post-Doctorat, Department of Biological Sciences, University of Warwick (UK).
  

• 2001-2004. Thèse (PhD), UMR 7619 Sisyphe, Université Paris VI.

• 2000-2001. DEA dEcologie Microbienne, Université Lyon I.

• Publications internationales

COLAS F., WOODWARD G., BURDON F. J., GUÉROLD F., CHAUVET E., CORNUT J. J., CÉBRON A., CLIVOT H., DANGER M., DANNER M. C., PAGNOUT C. C., TIEGS S. D., 2019. Towards a simple global-standard bioassay for a key ecosystem process: organic-matter decomposition using cotton strips. Ecological Indicators 106, 105466     Réf. HAL: hal-02317634.  [doi]

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