Mlle Aurélie CÉBRON
Chargée de Recherche CR1 CNRS
Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux
UMR 7360 CNRS - Université de Lorraine

Faculté des Sciences et Technologies BP 70239
54506 VANDOEUVRE-LES-NANCY, FRANCE

Tel :       +33(0)3 72 74 52 15
Fax :     +33(0)3 72 74 52 06
e-mail : aurelie.cebron(@)univ-lorraine.fr

Thématiques de recherche

Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP), composés majoritairement d'origine anthropique, ont été choisis comme modèles détude pour comprendre les mécanismes de biodégradation, par les microorganismes (bactéries, archaea et champignons), des polluants organiques « persistants » dans les sols. Dans les sols historiquement contaminés (friches industrielles), la biodégradation des HAP pourrait y être stimulée dans la rhizosphère de certaines plantes via l'action des exsudats racinaires. Les mécanismes impliqués méritent dêtre précisés, en prenant en compte la nature des exsudats racinaires, la disponibilité des HAP, et la diversité et l'activité des microorganismes.

Mes recherches visent à étudier le fonctionnement des sols historiquement contaminés et la dynamique des HAP dans les systèmes sol-plantes en me focalisant sur le fonctionnement spatio-temporel de la communauté microbienne fonctionnelle impliquée dans la biodégradation de ces polluants. Plus spécifiquement mes recherches ont pour objectifs de répondre aux questions suivantes : Quels sont les microorganismes présents et actifs dans les sols historiquement contaminés? Quels traits fonctionnels particuliers sont portés par ces communautés microbiennes? certaines fonctions essentielles y sont-elles absentes? Quel est le rôle des plantes, de la rhizosphère et des exsudats racinaires sur la diversité et l'activité microbienne, notamment l'activité de biodégradation des HAP?


 
Projets en cours
  • ANR JCJC RhizOrg, 2013-2017, « Organisation de la communauté microbienne et devenir des polluants dans la rhizosphère ». 

  • EC2CO EcoDyn, porteur P. Faure (LIEC), 2016-2017 « Conpet - Suivi de latténuation naturelle dune contamination pétrolière : Influence de différentes caractéristiques pédologiques (abiotiques) et biologiques (diversité microbienne, faunistique et floristique) ».

  • EC2CO EcoDyn, porteur F. Maunoury-Danger (LIEC), 2017-2018 « ECoBioS - Effets de la COntamination du sol et des litières produites sur le BIOta du Sol ».

  • LEFE-EC2CO MicrobiEn, porteur C. Cravo-Laureau (IPREM, Pau), 2017-2018 « TOTEM - Microbiologie des écosystèmes contaminés par les hydrocarbures sur un continuum terre-mer ».
Enseignements / Encadrements

Cours dispensé en Master II, UE-S9-12 partagée entre les Master Sol-Eau-Environnement et BioMane. "Adaptation aux polluants et voies métaboliques de biodégradation des microorganismes dans les sols".
 
Domaines de compétences
Ecologie microbienne; Diversité taxonomique et fonctionnelle (lien diversité-fonction, recherche des déterminants génétiques); Biodégradation des polluants organiques (hydrocarbures, HAP, pesticides); Sol et hétérogénéité spatiale; Rôle de la rhizosphère et des exsudats racinaires; Interactions entre bactéries, archaea et champignons; Biologie moléculaire (ADN/ARN, qPCR, fingerprinting, séquençage haut-débit Illumina MiSeq); Stable Isotope Probing DNA-SIP pour étudier les liens diversité-fonction.
 
Cursus / Carrière / Distinctions
  • depuis 2013. Chargée de Recherche, CR1-CNRS (section 30), LIEC UMR 7360, CNRS-Université de Lorraine.
  • 2012-2013. Chargée de Recherche, CR1-CNRS (section 20), LIMOS UMR 7137, CNRS-Nancy-Université.
  • 2007-2012. Chargée de Recherche, CR2-CNRS (section 20), LIMOS UMR 7137, CNRS-Nancy-Université.
  • 2005-2007. Post-Doctorat, LIMOS UMR 7137, CNRS-Nancy-Université.
  • 2005. Post-Doctorat, Department of Biological Sciences, University of Warwick (UK).
  • 2001-2004. Thèse (PhD), UMR 7619 Sisyphe, Université Paris VI.
  • 2000-2001. DEA dEcologie Microbienne, Université Lyon I.

Publications
  • Publications internationales

LEMMEL F., MAUNOURY-DANGER F., FANESI A., LEYVAL C., CÉBRON A., 2018. Soil Properties and Multi-Pollution Affect Taxonomic and Functional Bacterial Diversity in a Range of French Soils Displaying an Anthropisation Gradient. Microbial Ecology 1-21.  [doi]

BIACHE C., OUALI S., CÉBRON A., LORGEOUX C., COLOMBANO S., FAURE P., 2017. Bioremediation of PAH-contamined soils: Consequences on formation and degradation of polar-polycyclic aromatic compounds and microbial community abundance Journal Of Hazardous Materials 329, 43374.  [doi]

BOURCERET A., LEYVAL C., THOMAS F., CÉBRON A., 2017. Rhizosphere effect is stronger than PAH concentration on shaping spatial bacterial assemblages along centimetre-scale depth gradients Canadian Journal Of Microbiology 63 (11), 881-893.  [doi]

CRAMPON M., CÉBRON A., PORTET-KOLTALO F., UROZ S., LE DERF F., BODILIS J., 2017. Low effect of phenanthrene bioaccessibility on its biodegradation in diffusely contaminated soil Environmental Pollution 225, 663-673.  [doi]

FOUR B., THOMAS M., ARCE E., CÉBRON A., DANGER M., BANAS D., 2017. Fishpond dams affect leaf-litter processing and associated detritivore communities along intermittent low-order streams Freshwater Biology 62 (10), 1741-1755.  [doi]

BOURCERET A., CÉBRON A., TISSERANT E., POUPIN P., BAUDA P., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2016. The Bacterial and Fungal Diversity of an Aged PAH- and Heavy Metal-Contaminated Soil is Affected by Plant Cover and Edaphic Parameters Microbial Ecology 71 (3), 711-724.  [doi]

BRIMO K., GARNIER P., SUN S., BERTRAND-KRAJEWSKI J.-L., CÉBRON A., OUVRARD S., 2016. Using a Bayesian approach to improve and calibrate a dynamic model of polycyclic aromatic hydrocarbons degradation in an industrial contaminated soil Environmental Pollution 215, 27-37.  [doi]

JEANBILLE M., BUEE M., BACH C., CÉBRON A., FREY-KLETT P., TURPAULT M.-P., UROZ S., 2016. Soil Parameters Drive the Structure, Diversity and Metabolic Potentials of the Bacterial Communities Across Temperate Beech Forest Soil Sequences Microbial Ecology 71 (2), 482-493.  [doi]

THOMAS F., CÉBRON A., 2016. Short-Term Rhizosphere Effect on Available Carbon Sources, Phenanthrene Degradation, and Active Microbiome in an Aged-Contaminated Industrial Soil Frontiers In Microbiology 7, 92.  [doi]

THOMAS F., LORGEOUX C., FAURE P., BILLET D., CÉBRON A., 2016. Isolation and substrate screening of polycyclic aromatic hydrocarbon degrading bacteria from soil with long history of contamination International Biodeterioration & Biodegradation 107, 1-9.  [doi]

UROZ S., OGER P., TISSERAND E., CÉBRON A., TURPAULT M.-P., BUEE M., DE BOER W., LEVEAU J.-H.-J., FREY-KLETT P., 2016. Specific impacts of beech and Norway spruce on the structure and diversity of the rhizosphere and soil microbial communities Scientific Reports 6, 27756.  [doi]

BOURCERET A., CÉBRON A., TISSERANT E., POUPIN P., BAUDA P., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2015. The bacterial and fungal diversity of an aged PAH- and heavy metal-contaminated soil is affected by plant cover and edaphic parameters. Microbial Ecology 0.  [doi]

BOURCERET A., LEYVAL C., DE FOUQUET C., CÉBRON A., 2015. Mapping the centimeter-scale spatial variability of PAHs and microbial populations in the rhizosphere of two plants. Plos One 10(11):e0142851.  [doi]

CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., BONGOUA-DEVISME J., DENONFOUX J., FAURE P., LORGEOUX C., OUVRARD S., PARISOT N., PEYRET P., LEYVAL C., 2015. Impact of clay mineral, wood sawdust or root organic matter on the bacterial and fungal community structures in two aged PAH-contaminated soils. Environmental Science And Pollution Research 22, 13724-13738.  [doi]

CÉBRON A., ARSÈNE-PLOETZE F., BAUDA P., BERTIN P.-N., BILLARD P., CARAPITO C., DEVIN S., GOULHEN-CHOLLET F., POIREL J., LEYVAL C , 2014. Rapid Impact of Phenanthrene and Arsenic on Bacterial Community Structure and Activities in Sand Batches. Microbial Ecology 67, 129-144..  [doi]

BIACHE C., FAURE P., MANSUY-HUAULT L., CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C. , 2013. Biodegradation of the organic matter in a coking plant soil and its main constituents. Organic Geochemistry 56, 10-18..  [doi]

BONGOUA-DEVISME A.-J., CÉBRON A., KASSIN KE., YORO G.-R., MUSTIN C., BERTHELIN J. , 2013. Microbial Communities Involved in Fe Reduction and Mobility During Soil Organic Matter (SOM) Mineralization in Two Contrasted Paddy Soils. Geomicrobiology Journal 30, 347-361..  [doi]

CÉBRON A., FAURE P., LORGEOUX C., OUVRARD S., LEYVAL C. , 2013. Experimental increase in availability of a PAH complex organic contamination from an aged contaminated soil: Consequences on biodegradation. Environmental Pollution 177, 98-105..  [doi]

THION C., CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C. , 2013. Inoculation of PAH-degrading strains of Fusarium solani and Arthrobacter oxydans in rhizospheric sand and soil microcosms: microbial interactions and PAH dissipation. Biodegradation 24, 569-581..  [doi]

UROZ S., IOANNIDIS P., LENGELLE J., CÉBRON A., MORIN E., BUEE M., MARTIN F. , 2013. Functional Assays and Metagenomic Analyses Reveals Differences between the Microbial Communities Inhabiting the Soil Horizons of a Norway Spruce Plantation. Plos One 8, -..  [doi]

ZHOU X.-B., ZHOU J.-T., XIANG X.-M., CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C. , 2013. Impact of Four Plant Species and Arbuscular Mycorrhizal (AM) Fungi on Polycyclic Aromatic Hydrocarbon (PAH) Dissipation in Spiked Soil. Polish Journal Of Environmental Studies 22, 1239-1245..

LAURENT F., CÉBRON A., SCHWARTZ C., LEYVAL C., 2012. Oxidation of a PAH polluted soil using modified Fenton reaction in unsaturated condition affects biological and physico-chemical properties. Chemosphere 86, 659-664..  [doi]

THION C., CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2012. PAH biotransformation and sorption by Fusarium solani and Arthrobacter oxydans isolated from a polluted soil in axenic cultures and mixed cocultures, Int. Biodeterior. Biodegrad., 68:28-35.  [doi]

THION C., CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2012. Long-term in situ dynamics of the fungal communities in a multi-contaminated soil are mainly driven by plants. FEMS Microbiol. Ecol. 82, 169-82..  [doi]

CÉBRON A., CORTET J., CRIQUET S., BIAZ A., CALVERT V., CAUPERT C., PERNIN C., LEYVAL C., 2011. Biological functioning of PAH-polluted and thermal desorption-treated soils assessed by fauna and microbial bioindicators. Res. Microbiol. 162(9):896-907..  [doi]

CÉBRON A., LOUVEL B., FAURE P., FRANCE-LANORD C., CHEN Y., MURRELL J., LEYVAL C., 2011. Root exudates modify bacterial diversity of phenanthrene degraders in PAH-polluted soil but not phenanthrene degradation rates. Environ. Microbiol. 13 (3), 722-736.  [doi]

LOUVEL B., CÉBRON A., LEYVAL C., 2011. Root exudates affect biodegradation, bacterial community and functional gene expression in sand microcosms. Int. Biodeter. Biodeg. 55, 957-963..  [doi]

OUVRARD S., BARNIER C., BAUDA P., BÉGUIRISTAIN T., BIACHE C., BONNARD M., CAUPERT C., CÉBRON A., CORTET J., COTELLE S., DAZY M., FAURE P., MASFARAUD J.-F., NAHMANI J., PALAIS F., POUPIN P., RAOULT N., VASSEUR P., MOREL J.-L., LEYVAL C., 2011. In situ assessment of phytotechnologies for multicontaminated soil management. Int. J. Phytoremediation, 13, 245-263..  [doi]

SANON A., BÉGUIRISTAIN T., CÉBRON A., BERTHELIN J., SYLLA S., DUPONNOIS R., 2011. Differences in nutrient availability and mycorrhizal infectivity in soils invaded by an exotic plant negatively influence the development of indigenous Acacia species. J. Environ. Manage. ;95 Suppl:S275-9..  [doi]

QUEMENEUR M., CÉBRON A., BILLARD P., BATTAGLIA-BRUNET F., GARRIDO F., LEYVAL C., JOULIAN C., 2010. Population structure and abundance of arsenite-oxidizing bacteria along an arsenic pollution gradient in waters of the Upper Isle River Basin, France. Appl. Environ. Microbiol. 76(13), 4566-70.  [doi]

CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., FAURE P., NORINI M.-P., MASFARAUD J.-F., LEYVAL C., 2009. Influence of vegetation on the in situ bacterial community and polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) degraders in aged PAH-contaminated or thermal-desorption-treated soil Applied and Environmental Microbiology, 75 (19): 6322-6330.  [doi]

SANON A., BÉGUIRISTAIN T., CÉBRON A., BERTHELIN J., NDOYE I., LEYVAL C., SYLLA S., DUPONNOIS R., 2009. Changes in soil diversity and global activities following invasion of the exotic invasive plant, Amaranthus viridis L., decrease the growth of native sahelian Acacia species. FEMS Microbiology Ecology 70: 118-131..  [doi]

ZHOU X.-B., CÉBRON A., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2009. Water and phosphorus content affect PAH dissipation in spiked soil planted with mycorrhizal alfalfa and tall fescue, Chemosphere, 77, 709-713..  [doi]

CÉBRON A., NORINI M., BÉGUIRISTAIN T., LEYVAL C., 2008. Real-Time PCR quantification of PAH-Ring Hydroxylating Dioxygenase (PAH-RHDa) genes from Gram positive and Gram negative bacteria in soil and sediment sample, Journal of Microbiological Methods, 73, 148-159..  [doi]