Mme Bénédicte SOHM
Ingénieur de recherche
Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux
UMR 7360 CNRS - Université de Lorraine

Campus Bridoux, Bât. IBISE, 8 rue du Général Delestraint
57070 METZ, FRANCE

Tel :       +33(0)3 72 74 89 42
e-mail : benedicte.sohm(@)univ-lorraine.fr
Responsabilités administratives
Responsable du Pôle de compétence Vivant
Membre nommé du Conseil scientifique du LIEC
Service de protéomique et transcriptomique
 
Missions
Concevoir, développer et conduire les approches transcriptomique, protéomique, biologie moléculaire et d'analyse cellulaire par cytométrie en flux dans le cadre des projets de recherche des utilisateurs du service et des partenaires scientifiques
Concevoir et établir le cahier des charges, assurer une démarche qualité
Réaliser la veille scientifique et technologique relative à ces approches méthodologiques et en assurer la diffusion
Conseiller les utilisateurs sur les possibilités et limites des techniques
Diffuser et valoriser les résultats des développements technologiques
 
Domaines de compétences
Protéomique, spectromètrie de masse (MALDI-TOF/TOF, LC-MS/MS), transcriptomique, qPCR, biologie moléculaire et cellulaire, cytomètrie en flux, culture cellulaire, transfection transitoire, expression et purification de protéines recombinante (FPLC), western-blot, biochimie
 
Cursus / Carrière / Distinctions

2007  2010 :  Postdoctorat : Responsable développement projets « Protéomique », Biocenter (Directeur : Prof. L. Huber), Medical University, Innsbruck, Autriche.

  • Equipes: Laboratoire des Prof. S. Geley, Prof. A. Villunger
  • Financement: Projet SFB021 « Cell proliferation and cell death in tumors »
  • Mise en place de nouvelles technologies de protéomique en support aux équipes impliquées dans le projet SFB021, analyse des échantillons par spectrométrie de masse pour différents utilisateurs.
  • Collaborations : Laboratoire de  Dr. D. Höller (Biocenter, Innsbruck) et Prof. G. Bonn (Institute of Analytical Chemistry, Innsbruck)

2004  2007    Ingénieure technico-commercial, DAKO SAS, Trappes, Paris (secteur Grand Est)

2000  2003    Stage doctoral : CNRS, UPR 9002, IBMC, Strasbourg, France (directeur: Jules Hoffmann) - Directrice de thèse: Prof. C. Florentz                       

  • Financement : Allocation MENRT
  • Sujet : Etude de limpact de mutations pathologiques dans les ARNt mitochondriaux humains sur les propriétés daminoacylation et sur le protéome mitochondrial.
  • Collaborations : Laboratoires des Prof. A. Van Dorsselaer (Strasbourg, France), Dr A. Przykorska (Warsaw, Poland), Dr M. King (Philadelphia, USA).
  • Thèse diponible en ligne : http://scd-theses.u-strasbg.fr/824/
1.    Singh PK, Roukounakis A, Weber A, Das KK, Sohm B, Villunger A, Garcia-Saez AJ, Häcker G. Dynein light chain binding determines complex formation and posttranslational stability of the Bcl-2 family members Bmf and Bim. Cell Death Differ. 2020, 27 :434-450. doi: 10.1038/s41418-019-0365-y
2.    Técher D, Grosjean N, Sohm B, Blaudez D, Le Jean M. Not merely noxious? Time-dependent hormesis and differential toxic effects systematically induced by rare earth elements in Escherichia coli. Environ Sci Pollut Res Int. 2020, 27 : 5640-49. Doi: 10.1007/s11356-019-07002-z.
3.    Péden R, Poupin P, Sohm B, Flayac J, Giambérini L, Klopp C, Louis F, Pain-Devin S, Potet M, Serre RF, Devin S. Environmental transcriptomes of invasive dreissena, a model species in ecotoxicology and invasion biology. Sci Data. 2019, 25;6(1):234. doi: 10.1038/s41597-019-0252-x.
4.    Koehle-Divo V, Sohm B, Giamberini L, Pauly D, Flayac J, Devin S, Auffan M, Mouneyrac C, Pain-Devin S. A sub-individual multilevel approach for an integrative assessment of CuO nanoparticle effects on Corbicula fluminea. Environ Pollut. 2019 Jul 27;254(Pt A):112976. doi: 10.1016/j.envpol.2019.112976.
5.    Pagnout C, Sohm B, Razafitianamaharavo A, Caillet C, Offroy M, Leduc M, Gendre H, Jomini S, Beaussart A, Bauda P, Duval JFL. Pleiotropic effects of rfa-gene mutations on Escherichia coli envelope properties. Sci Rep. 2019, 4 ; 9:9696. doi: 10.1038/s41598-019-46100-3.
6.    Parant M, Sohm B, Flayac J, Perrat E, Chuburu F, Cadiou C, Rosin C, Cossu-Leguille C. Impact of gadolinium-based contrast agents on the growth of fish cells lines.  Ecotoxicol Environ Saf. 2019 Oct 30;182:109385. doi: 10.1016/j.ecoenv.2019.109385.
7.    Vicente A, Sohm B, Flayac J, Rousselle P, Bauda P, Pagnout C. Toxicity mechanisms of ZnO UV-filters used in sunscreens toward the model cyanobacteria Synechococcus elongatus PCC 7942. Environ Sci Pollut Res Int. 2019. Doi: 10.1007/s11356-019-05057-6.
8.    Koehlé-Divo V, Pain-Devin S, Bertrand C, Devin S, Mouneyrac C, Giambérini L, Sohm B. Corbicula fluminea gene expression modulated by CeO2 nanomaterials and salinity. Environ Sci Pollut Res Int. 2019, 26:15174-15186. Doi: 10.1007/s11356-019-04927-3.
9.    Koehlé-Divo V, Cossu-Leguille C, Pain-Devin S, Simonin C, Bertrand C, Sohm B, Mouneyrac C, Devin S, Giambérini L. 2018. Genotoxicity and physiological effects of CeO2 NPs on a freshwater bivalve Corbicula fluminea. Aquat Toxicol. 198:141-148.
10.    Présent RM, Rotureau E, Billard P, Pagnout C, Sohm B, Flayac J, Gley R, Pinheiro JP, Duval JFL. 2017. Impact of intracellular metallothionein on metal biouptake and partitioning dynamics at bacterial interfaces. Phys Chem Chem Phys. 8 ;19:29114-29124.
11.    Rollin M, Coulaud R, Danger M, Sohm B, Flayac J, Bec A, Chaumot A, Geffard O, Felten V. 2017. Additive effect of calcium depletion and low resource quality on Gammarus fossarum (Crustacea, Amphipoda) life history traits. Environ Sci Pollut Res Int. doi: 10.1007/s11356-017-9390-x.
12.    Vellinger C., Sohm B., Parant M., Immel F., Usseglio-Polatera P. 2016. Investigating the emerging role of comparative proteomics in the search for new biomarkers of metal contamination under varying abiotic conditions. Science Of The Total Environment 562 ; 974-986.
13.    Podmirseg SR., Jäkel H., Ranches GD., Kullmann MK., Sohm B., Villunger A., Lindner H., Hengst L. 2016. Caspases uncouple p27Kip1 from cell cycle regulated degradation and abolish its ability to stimulate cell migration and invasion. Oncogene, 1 ; 35:4580-90.
14.    Garaud M., Auffan M., Devin S., Felten V., Pagnout C., Pain-Devin S., Rodius F., Sohm B., Giamberini L. 2016. Integrated assessment of ceria nanoparticle impacts on the freshwater bivalve Dreissena polymorpha: a mesocosm approach. Nanotoxicology 10 ; 935-944.
15.    Bock FJ., Tanzer MC., Haschka MD., Krumschnabel G., Sohm B., Goetsch K., Kofler R., Villunger A., 2015. The p53 binding protein PDCD5 is not rate-limiting in DNA damage induced cell death. Scientific Reports 11;11268.
16.    Sohm B., Immel F., Bauda P., Pagnout C. 2015. Insight into the primary mode of action of TiO2 nanoparticles on Escherichia coli in the dark. Proteomics 15(1): 98-113.
17.    Toumi H., Boumaiza M., Immel F., Sohm B., Felten V., Ferard JF. 2014. Effect of deltamethrin (pyrethroid insecticide) on two clones of Daphnia magna (Crustacea, Cladocera): a proteomic investigation. Aquat Toxicol, 148; 40-47.
18.    Minguez L., Brule N., Sohm B., Devin S. & Giamberini L. 2013. Involvement of apoptosis in host-parasite interactions in the zebra mussel. PLoS One, 8, e65822.
19.    Grespi F., Soratroi C., Krumschnabel G., Sohm B., Ploner C., Geley S., Hengst L., Häcker G. & Villunger A. 2010. The BH3-only protein Bmf is generated by non-AUG mediated translation and triggers apoptosis upon inhibition of CAP-dependent protein synthesis. Cell Death Diff. 17; 1672-83.
20.    Barisic M., Sohm B., Mikolcevic P., Wandke C., Rauch V., Ringer T., Hess M., Bonn G. & Geley S. 2010. Spindly/CCDC99 is required for efficient chromosome congression and mitotic checkpoint regulation. Mol Biol Cell 15; 1968-81.
21.    Manzl C., Krumschnabel G., Bock F., Sohm B., Labi V., Baumgartner F., Logette E., Tschopp J. & Villunger A. 2009. Caspase-2 activation in the absence of PIDDosome formation. J Cell Biol. 20; 291-303.
22.    Krumschnabel G., Sohm B., Bock F., Manzl C. & Villunger A. 2009. The enigma of caspase-2: the laymen's view. Cell Death Differ. 1; 195-207.
23.    Sohm B., Sissler M., Park H., King M. & Florentz C. 2004. Recognition of human mitochondrial tRNALeu(UUR) by its cognate Leucyl-tRNA synthetase. J Mol Biol. 339; 17-29
24.    Troyen-Toth P., Richert S., Sohm B., Mine M., Marsac C., Van Dorsselaer A., Leize E. & Florentz C. 2003. Proteomic consequences of human mitochondria tRNA mutation outside the frame of mitochondrial translation. J. Biol. Chem. 278; 24314-23.
25.    Florentz C., Sohm B., Troyen-Toth P., Pütz J. & Sissler M. 2003. Human mitochondrial tRNAs in health and disease. Cell. Mol. Life Sci., 60; 1356-75.
26.    Sohm B., Frugier M., Brulé H., Olzak K., Przykorska A. & Florentz C. 2003. Towards understanding human mitochondrial leucine identity. J. Mol. Biol. 328; 995-1010.